Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Capn7Q9R1S8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capn7Q9R1S8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn7Q9R1S8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn7Q9R1S8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.5 ms