Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AmfrQ9R049 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AmfrQ9R049 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AmfrQ9R049 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AmfrQ9R049 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms