Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms