Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trpc3Q9QZC1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc3Q9QZC1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc3Q9QZC1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc3Q9QZC1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc3Q9QZC1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc3Q9QZC1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms