Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn8Q9QZ49 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn8Q9QZ49 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ubxn8Q9QZ49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ubxn8Q9QZ49 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn8Q9QZ49 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn8Q9QZ49 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn8Q9QZ49 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn8Q9QZ49 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn8Q9QZ49 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn8Q9QZ49 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn8Q9QZ49 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn8Q9QZ49 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn8Q9QZ49 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms