Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm40Q9QYA2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tomm40Q9QYA2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm40Q9QYA2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms