Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm4Q9QXA5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm4Q9QXA5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm4Q9QXA5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm4Q9QXA5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lsm4Q9QXA5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lsm4Q9QXA5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm4Q9QXA5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lsm4Q9QXA5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm4Q9QXA5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms