Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hdgfl3Q9JMG7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdgfl3Q9JMG7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl3Q9JMG7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms