Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SrfQ9JM73 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SrfQ9JM73 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrfQ9JM73 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SrfQ9JM73 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrfQ9JM73 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms