Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf19Q9JLL3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.6 ms