Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bace2Q9JL18 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bace2Q9JL18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bace2Q9JL18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace2Q9JL18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bace2Q9JL18 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms