Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmx1aQ9JKU8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmx1aQ9JKU8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmx1aQ9JKU8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmx1aQ9JKU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmx1aQ9JKU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms