Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Habp4Q9JKS5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Habp4Q9JKS5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Habp4Q9JKS5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Habp4Q9JKS5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Habp4Q9JKS5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms