Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl3Q9JKB1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uchl3Q9JKB1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl3Q9JKB1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uchl3Q9JKB1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uchl3Q9JKB1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl3Q9JKB1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms