Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Alyref2Q9JJW6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Alyref2Q9JJW6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Alyref2Q9JJW6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Alyref2Q9JJW6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alyref2Q9JJW6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alyref2Q9JJW6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alyref2Q9JJW6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms