Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Riox1Q9JJF3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Riox1Q9JJF3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riox1Q9JJF3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Riox1Q9JJF3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riox1Q9JJF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms