Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIB4

Gtf2h2, General transcription factor IIH subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h2Q9JIB4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h2Q9JIB4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h2Q9JIB4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2h2Q9JIB4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf2h2Q9JIB4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2h2Q9JIB4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2h2Q9JIB4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2h2Q9JIB4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h2Q9JIB4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2h2Q9JIB4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms