Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RabggtaQ9JHK4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RabggtaQ9JHK4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RabggtaQ9JHK4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RabggtaQ9JHK4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
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