Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Brd4Q9ESU6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Brd4Q9ESU6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Brd4Q9ESU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Brd4Q9ESU6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Brd4Q9ESU6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Brd4Q9ESU6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.19
Brd4Q9ESU6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Brd4Q9ESU6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Brd4Q9ESU6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
Brd4Q9ESU6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Brd4Q9ESU6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Brd4Q9ESU6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Brd4Q9ESU6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Brd4Q9ESU6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Brd4Q9ESU6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Brd4Q9ESU6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Brd4Q9ESU6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Brd4Q9ESU6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Brd4Q9ESU6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Brd4Q9ESU6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms