Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim54Q9ERP3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim54Q9ERP3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim54Q9ERP3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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