Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn3Q9ERG2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Strn3Q9ERG2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn3Q9ERG2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn3Q9ERG2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn3Q9ERG2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms