Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr6Q9EQ16 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcr6Q9EQ16 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr6Q9EQ16 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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