Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tlr6Q9EPW9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlr6Q9EPW9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr6Q9EPW9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr6Q9EPW9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr6Q9EPW9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms