Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r172Q9EPS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r172Q9EPS4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r172Q9EPS4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r172Q9EPS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r172Q9EPS4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r172Q9EPS4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r172Q9EPS4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r172Q9EPS4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vmn1r172Q9EPS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r172Q9EPS4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms