Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MNCb-2875Q9DCB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MNCb-2875Q9DCB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MNCb-2875Q9DCB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MNCb-2875Q9DCB3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MNCb-2875Q9DCB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MNCb-2875Q9DCB3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MNCb-2875Q9DCB3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms