Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ7

Scyl3, Protein-associating with the carboxyl-terminal domain of ezrin, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scyl3Q9DBQ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scyl3Q9DBQ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scyl3Q9DBQ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scyl3Q9DBQ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scyl3Q9DBQ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scyl3Q9DBQ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scyl3Q9DBQ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Scyl3Q9DBQ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scyl3Q9DBQ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scyl3Q9DBQ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scyl3Q9DBQ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scyl3Q9DBQ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scyl3Q9DBQ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms