Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift43Q9DA69 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ift43Q9DA69 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift43Q9DA69 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift43Q9DA69 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms