Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem239Q9DA47 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem239Q9DA47 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms