Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9E0

Slc22a17, Solute carrier family 22 member 17, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a17Q9D9E0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc22a17Q9D9E0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc22a17Q9D9E0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc22a17Q9D9E0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc22a17Q9D9E0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc22a17Q9D9E0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc22a17Q9D9E0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc22a17Q9D9E0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc22a17Q9D9E0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms