Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700109H08RikQ9D9C0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700109H08RikQ9D9C0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700109H08RikQ9D9C0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700109H08RikQ9D9C0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms