Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 367.3 ms