Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1qtnf2Q9D8U4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1qtnf2Q9D8U4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1qtnf2Q9D8U4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qtnf2Q9D8U4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms