Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgap3Q9D8S3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgap3Q9D8S3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap3Q9D8S3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap3Q9D8S3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms