Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K8

Slc25a39, Solute carrier family 25 member 39, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a39Q9D8K8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc25a39Q9D8K8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc25a39Q9D8K8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc25a39Q9D8K8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc25a39Q9D8K8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc25a39Q9D8K8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc25a39Q9D8K8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc25a39Q9D8K8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc25a39Q9D8K8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc25a39Q9D8K8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms