Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Alkbh4Q9D8F1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Alkbh4Q9D8F1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Alkbh4Q9D8F1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266.7 ms