Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajc4Q9D844 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajc4Q9D844 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Dnajc4Q9D844 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc4Q9D844 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc4Q9D844 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc4Q9D844 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc4Q9D844 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc4Q9D844 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc4Q9D844 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnajc4Q9D844 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms