Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmigd1Q9D7L8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd1Q9D7L8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd1Q9D7L8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd1Q9D7L8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmigd1Q9D7L8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd1Q9D7L8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd1Q9D7L8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd1Q9D7L8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmigd1Q9D7L8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms