Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Chmp4cQ9D7F7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chmp4cQ9D7F7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chmp4cQ9D7F7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms