Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip1Q9D620 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip1Q9D620 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip1Q9D620 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip1Q9D620 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip1Q9D620 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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