Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q9D5Q8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q9D5Q8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q9D5Q8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9D5Q8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q9D5Q8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D5Q8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms