Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zcchc13Q9D548 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc13Q9D548 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zcchc13Q9D548 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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