Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D4W2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D4W2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D4W2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D4W2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D4W2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D4W2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D4W2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D4W2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D4W2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms