Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931428L18RikQ9D4S9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4931428L18RikQ9D4S9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4931428L18RikQ9D4S9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4931428L18RikQ9D4S9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931428L18RikQ9D4S9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms