Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubgcp4Q9D4F8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp4Q9D4F8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp4Q9D4F8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms