Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrp2bpQ9D4C6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrp2bpQ9D4C6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrp2bpQ9D4C6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrp2bpQ9D4C6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrp2bpQ9D4C6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrp2bpQ9D4C6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms