Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce1Q9D495 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syce1Q9D495 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syce1Q9D495 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce1Q9D495 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce1Q9D495 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syce1Q9D495 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syce1Q9D495 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syce1Q9D495 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syce1Q9D495 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syce1Q9D495 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syce1Q9D495 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syce1Q9D495 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syce1Q9D495 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms