Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam227aQ9D3V8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam227aQ9D3V8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam227aQ9D3V8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam227aQ9D3V8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms