Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P2

5330417H12Rik, MCG147567, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5330417H12RikQ9D3P2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
5330417H12RikQ9D3P2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5330417H12RikQ9D3P2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5330417H12RikQ9D3P2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5330417H12RikQ9D3P2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
5330417H12RikQ9D3P2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
5330417H12RikQ9D3P2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
5330417H12RikQ9D3P2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
5330417H12RikQ9D3P2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
5330417H12RikQ9D3P2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
5330417H12RikQ9D3P2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5330417H12RikQ9D3P2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
5330417H12RikQ9D3P2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
5330417H12RikQ9D3P2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms