Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rasgef1cQ9D300 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rasgef1cQ9D300 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasgef1cQ9D300 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rasgef1cQ9D300 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rasgef1cQ9D300 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms