Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx20Q9D2Y5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx20Q9D2Y5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx20Q9D2Y5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx20Q9D2Y5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx20Q9D2Y5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms